Colecția de plante superioare cuprinde un număr de 74.020 exemplare caracteristice pentru flora și vegetația regiunii est-carpatice, dar și specii din alte regiuni ale țării obținute prin achiziții, donații sau colectare.
În cadrul muzeului începând din anul 1970 colecția Flora Moldavae Exsiccata, colecție care conține în cele 7 centurii 70.000 coli de ierbar pregătite pentru schimb. Colecția de plante superioare numără 16.000 piese primite la schimb din America de Nord, America de Sud, Africa, Asia, Australia și Europa.
Colecția de plante superioare cuprinde 3000 specii dintre cele 3400 citate pentru flora României, fiind valoroasă din punct de vedere științific pentru taxonomie și stabiulirea arealului de răspândire a diferiților taxoni. De asemeni, sunt conservate piese colectate din toate ecosistemele județului Bacău, printre care se numără și: Saxifraga cimballaria, Cypripedium calceolus, Nigritella rubra.
.: Plante inferioare
.: Mamologie
.: Ornitologie
.: Herpetologie
.: Plante superioare
.: Entomologie
.: Geologie și paleontologie
.: Animale vii
.: Malacologie